栽培桔梗花的时候，会出现虫害问题，因此需要进行虫害防治。根腐病，就是根部受到危害，有黑褐斑点出现在受害根部，在后期会因为腐烂而全部枯死；防治方法为，以1000倍的多菌灵浇灌病区，在雨后要注意排水，在田间种植的桔梗花不要太过湿润。

白粉病，主要是叶片受到危害，在发病的时候，病叶上有灰粉末满布，严重情况的可造成全株枯萎；防治方法为在发病初期，可使用波美0.3度石硫合剂、白粉净500倍液、20%的粉锈宁粉1800倍液，在这其中选择一种进行喷洒。蚜虫，危害最为严重的时期为6-7月，可用40%乐果1500～2000倍液喷施，每7-10天喷洒一次，连续喷三次就可以了。

需要注意的是，在桔梗花生长期的时候，可以用常规方法防治所发现的其他害虫，在收获的前20天不要使用农药。我国大部分地区，有过多杂草出现在种植桔梗花期间，从而影响了桔梗花的生长，除草要注意区别对待，可根据当地植保部门的推荐，依照比例在桔梗花地之内进行小面积的试验，若无碍桔梗花，再进行大面积的推广使用，这样可以避免影响桔梗花的生长。